Na minulosť aj kauzy Jána Počiatka si posvietili Aktuality.sk a podarilo sa im zozbierať zoznam 11 káuz, v ktorých figuroval aj exminister. Aj keď sa ho opozícia viackrát snažila odvolať, vo vláde sa mu v predchádzajúcich rokoch ušli až dve ministerské kreslá.
V roku 2008 dovolenkoval minister financií Ján Počiatek v Monaku. Nejaký čas strávil aj na jachte Ivana Jakaboviča, známeho finančníka z J&T. Bolo to v čase, keď slovenskej korune odbíjali posledné dni a mal sa zverejniť konverzný kurz pri prechode na euro. Na prevode koruny na európsku menu neskôr zarobila veľké peniaze práve J&T a skupina Istrokapital. Počiatek neskôr popieral, že na lodi sa s Jakabovičom bavili aj o zmene meny.
V tom istom roku po dlhom spore prehrala štátna stávková spoločnosť Tipos súd o názvy svojich hier. Prebrala ich totiž od firmy Športka. Odškodné mala zaplatiť schránkovej firme Lemikon Limited, ktorá sídlila na tej istej adrese na Cypre ako spoločnosť vlastnená J&T. Z odškodného vymeraného na 66 miliónov eur nakoniec štát zaplatil 16. Po verejnom tlaku sa neskôr zmenila legislatíva a generálny prokurátor podal odvolanie. Minulý rok Tipos súd vyhral.
Za éry Počiatka ako ministra dopravy sa udiala aj kauza súvisiaca s výstavbou ciest či železníc, po ktorej ostali nevyplatené faktúry vo výške niekoľkých desiatok miliónov. Firmy ako TSS Grade, Doprastav a Váhostav išli do reštrukturalizácie a ich subdodávatelia svoje peniaze nedostali, hoci veľké firmy štát zaplatil.
Čerstvá kauza DPH, ktorá vypukla priamo pred voľbami, keď sa na verejnosť dostali podrobnosti z výpovede Martina Chovanca. Ten tvrdil, že podvody za 75 miliónov eur kryli aj Robert Kaliňák a Ján Počiatek. Obaja na Chovanca podali žaloby.
Počas výstavy diaľničného mosta v roku 2010 zahynuli pri nehode štyria robotníci. Počiatek bol na dovolenke v Dubaji, tú neprerušil a vrátil sa až tri dni po tragédii.
Ministerstvo dopravy vypísalo aj tender na diaľničný obchvat Bratislavy. Prvé odhady ceny boli až štyri miliardy eur, neskôr po kritike rezort cenu znížil na 1,9 miliardy. Napriek tomu, že Počiatkovi radili, aby odsúhlasenie sumy nechal na novú vládu, stihol to urobiť ešte pred voľbami.
Počiatek okrem iného vlastní aj byt v známom komplexe Bonaparte, kde býva aj Robert Fico. Komplex vlastní aj podnikateľ Ladislav Bašternák. Problémy sa vyskytli aj pri mýte a zavádzaní palivových kariet. Spoločnosť SkyToll, ktorá prevádzkuje mýto, dala systém palivových kariet na starosť firme Fleetbay bez verejnej súťaže. Tento krok Slovensku vytkla aj Európska komisia. Neskôr vypísali tender, ktorý na odporúčanie Fleetpay vyhrala spoločnosť Paywell.
Podľa Aktualít.sk je Počiatek aj za Donovalským pivovarom, ktorý je otvorený v lyžiarskom stredisku. Úver na jeho vybudovanie poskytla štátna Slovenská záručná a rozvojová banka. Spolumajiteľ je aj Mário Partl, ktorý bol za Počiatka zamestnaný na rezorte dopravy.
Elektronické vymáhanie pokút nefunguje a za systémom elektronických diaľničných známok je práve Národná diaľničná spoločnosť, ktorá systém obstarávala počas Počiatkovho šéfovania ministerstvu dopravy. Poslednou z káuz je aj informatizácia verejnej správy, na ktorej sa podieľala aj firma Anext. Aj keď chýbali presvedčivé dôkazy, Aktuality.sk tvrdia, že Počiatek mal na spoločnosť napojenie.